Kysymys:
Mikä on nopea tapa löytää käänteinen komplementti bashista
winni2k
2019-04-15 14:46:13 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Minulla on DNA-sekvenssi, jonka haluaisin löytää nopeasti käänteisen komplementin. Onko olemassa nopea tapa tehdä tämä bash-komentorivillä vain GNU-työkalujen avulla?

Kaksi vastused:
winni2k
2019-04-15 14:46:13 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Kiitos Manu Tammiselle tästä ratkaisusta:

  echo ACCTTGAAA | tr ACGTacgt TGCAtgca | rev  
Ja jos haluan laittaa sen muuttujaan kaikun sijaan?
Liitän koodin dollariin () ja määritän muuttujalle olettaen, että käytät viimeisintä versiota bashista.
se toimii kiitos!
thomas duge de bernonville
2020-04-29 14:02:25 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Voit joko asentaa kohokuviointipaketin ( http://emboss.sourceforge.net/download/) ja käyttää revseq-ohjelmaa. Se sisältää monia hyödyllisiä komentoriviohjelmia, kuten pariliitoksen työkaluneula.



Tämä Q & A käännettiin automaattisesti englanniksi.Alkuperäinen sisältö on saatavilla stackexchange-palvelussa, jota kiitämme cc by-sa 4.0-lisenssistä, jolla sitä jaetaan.
Loading...